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這篇文章主要介紹了HPA是什么數(shù)據(jù)庫，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。
HPA全稱是Human Protein Atls， 利用轉錄組學和蛋白質組學技術，從RNA和蛋白水平研究人類不同組織和器官中的蛋白表達情況，網(wǎng)址如下
https://www.proteinatlas.org/
根據(jù)32個不同組織中蛋白編碼基因的RNA_seq數(shù)據(jù)，將基因進行了分類，結果如下所示
鑒于分泌蛋白，膜相關蛋白在病理生理學中的重要作用，將蛋白劃分了下圖所示的不同類別進行研究
通過不同組織中的RNA_seq數(shù)據(jù)，分析了蛋白編碼基因在不同組織中的富集情況，如下所示
可以看到在腦組織中，膜香瓜蛋白較多，而在肺中，分泌蛋白較多。除了對不同組織/細胞中的蛋白表達進行比較分析，還進一步研究了不同腫瘤中蛋白的表達情況。
在HPA中，又進一步劃分成了以下3個子類
用于查看和分析蛋白編碼基因在不同組織和器官中的表達情況，以MYL7為例，鏈接如下
https://www.proteinatlas.org/ENSG00000106631-MYL7/tissue
結果示意如下
提供了蛋白編碼基因在不同細胞系中的表達情況，同時還體用了對應的亞細胞定位信息，以CCNB1為例，鏈接如下
https://www.proteinatlas.org/ENSG00000134057-CCNB1/cell
結果示意如下
提供了基因在腫瘤組織中的表達情況，以及生存分析，病理學圖像等結果，以MK167為例，鏈接如下
https://www.proteinatlas.org/ENSG00000148773-MKI67/pathology
結果示意如下
通過HPA數(shù)據(jù)庫，可以方便的探究蛋白編碼基因在正常和腫瘤組織/器官中的表達情況。
感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“HPA是什么數(shù)據(jù)庫”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關注億速云行業(yè)資訊頻道，更多相關知識等著你來學習!
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