mir2disease數(shù)據(jù)庫有什么用

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mir2disease是由哈爾濱工業(yè)大學(xué)開發(fā)的miRNA相關(guān)疾病數(shù)據(jù)庫，網(wǎng)址如下

http://www.mir2disease.org/

該數(shù)據(jù)庫包含了349個miRNA, 163種疾病，3273個miRNA與疾病之間的關(guān)聯(lián)信息。

對于miRNA在疾病組織中的失調(diào)，給出了以下3種模型

• miRNA位于致病的基因組位點，比如雜合性缺失LOH區(qū)域等，有研究發(fā)現(xiàn)，miR-15和miR-16位于13號染色體的13q14區(qū)域，在慢性淋巴B細胞白血病中，該染色體區(qū)域會缺失，導(dǎo)致這兩個miRNA的表達量缺失或下調(diào)。

• miRNA的異常由表觀遺傳引起，包括DNA甲基化與組蛋白修飾，有研究發(fā)現(xiàn)，let-7a-3基因的啟動子區(qū)在正常組織中是高度甲基化的，在肺癌組織中低甲基化。啟動子區(qū)的去甲基化導(dǎo)致具有致癌功能的let-7a-3在肺癌細胞中再度激活，表達量上調(diào)。

• miRNA在疾病組織中的失調(diào)與相關(guān)酶的缺失有關(guān)系，有研究發(fā)現(xiàn)，miR-24和miR-93靶向調(diào)控病毒蛋白，在Dicer酶缺失的細胞中，由于宿主細胞miR-24和miR-93的缺失，導(dǎo)致VSV復(fù)制增加。

對于miRNA與疾病關(guān)聯(lián)的每條記錄，會給出miRNA ID, 疾病名稱，檢測方法，miRNA靶基因信息和對應(yīng)的文獻，和HMDD數(shù)據(jù)庫的整體架構(gòu)非常類似。

支持通過以下3種方式對數(shù)據(jù)庫進行檢索

以miRNA ID為例，直接點擊search按鈕，會顯示所有的miRNA, 然后勾選感興趣，可有多選，然后在進行檢索就可以了

檢索結(jié)果示意如下

點擊Detail可以查看詳細信息，示意如下

該數(shù)據(jù)庫是免費下載的，提供了miRNA靶基因，相關(guān)疾病等信息，示意如下

相比HMDD, 該數(shù)據(jù)庫中收錄的miRNA與疾病的關(guān)聯(lián)信息會少一點，但是仍然是一個非常實用的數(shù)據(jù)庫。

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