R語言ggplot2怎樣畫熱圖添加分組信息的顏色條

 

之前有人在公眾號留言問文章開頭這幅圖如何實現(xiàn)，下面的B圖是折線圖加柱形圖，相對比較容易實現(xiàn)，上面的A圖稍微有點復(fù)雜，我想到的辦法是拼圖，圖A可以看成三個熱圖，然后加一個堆積柱形圖，最后將四個圖組合到一起。那就按照這個思路試一下看能不能實現(xiàn)。

最初的想法是左側(cè)的顏色條用堆積柱形圖來實現(xiàn)，又看了一遍Y叔公眾號關(guān)于aplot這個包的推文，發(fā)現(xiàn)他是用geom_tile()函數(shù)實現(xiàn)的，仔細(xì)想想還是geom_tile()函數(shù)實現(xiàn)起來比較方便。

非常感謝下面這位的留言

文本添加下劃線的小例子

df<-data.frame(A=1:10,
               B=1:10)
library(ggplot2)
ggplot(df,aes(A,B))+
  geom_point(size=5)+
  theme_minimal()+
  ggtitle(expression(underline("Good Good Study, Day Day Up")))+
  labs(x=expression(paste(italic("ABC"),"123")))

 

下面進(jìn)入今天推文的正式內(nèi)容

 

如何畫這個熱圖昨天的推文已經(jīng)介紹過了，點擊下方藍(lán)色字可以直達(dá)昨天的推文

R語言ggplot2畫帶有空白格的熱圖簡單小例子

 

df2<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap_color_bar.csv",header=T)
df2$y<-factor(df2$y,levels = rev(df2$y))
ggplot(df2,aes(x=x,y=y))+
  geom_tile(aes(fill=group))+
  scale_x_continuous(expand = c(0,0))+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.text.x = element_blank(),
        legend.position = "left",
        legend.title = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("green","blue","red"))

 

library(aplot)
library(ggplot2)
df<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T)
df1<-reshape2::melt(df)
df1$value1<-ifelse(is.na(df1$value),0,df1$value)
df1$value1<-as.factor(df1$value1)
df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A))
p1<-ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
  geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
  scale_fill_manual(values = c("white","orangered","red2","red4"))+
  scale_x_discrete(position = "top")+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.text.x.top = element_text(angle = 90,
                                       hjust = 0,
                                       vjust= 0.5),
        plot.title = element_text(hjust=0.5),
        legend.position = "none")+
  labs(title = expression(underline("Plant growth and development")))+
  geom_text(aes(label=value1,color=value1))+
  scale_color_manual(values = c("white","black","black","black"))



df2<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap_color_bar.csv",header=T)
df2$y<-factor(df2$y,levels = rev(df2$y))
p2<-ggplot(df2,aes(x=x,y=y))+
  geom_tile(aes(fill=group))+
  scale_x_continuous(expand = c(0,0))+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.text = element_blank(),
        legend.position = "left",
        legend.title = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("green","blue","red"))

p1%>%
  insert_left(p2,width = 0.05)

 

這里遇到一個問題是如何將右側(cè)的圖例放大左上角去？用代碼如何實現(xiàn)我暫時還不知道，出圖以后手動編輯吧！

p3<-p1+
  theme(axis.text.y = element_blank())
pdf(file = "123.pdf",width = 12)
p1%>%
  insert_left(p2,width = 0.05)%>%
  insert_right(p3)%>%
  insert_right(p3)
dev.off()