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Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法

發(fā)布時(shí)間:2020-08-28 16:03:42 來源:腳本之家 閱讀:1159 作者:Darlewo 欄目:開發(fā)技術(shù)

mhd格式的文件里面包含的是raw圖像的一些頭信息,比如圖片大小,拍攝日期等等,那么如何可視化圖像呢?

import cv2
import SimpleITK as sitk
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
image =sitk.ReadImage(path)
image = sitk.GetArrayFromImage(image)
#image = np.squeeze(image[slice, ...]) # if the image is 3d, the slice is integer
plt.imshow(image,cmap='gray')
plt.axis('off')
plt.show()
cv2.imwrite('1.png',image)

這里path是mhd文件的路徑,并且在該路徑下需要有相應(yīng)的raw文件

這里展示一下我的mdk文件和保存的png文件

Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法

Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法

在這里如果cv2和ITK模塊沒有的話可以用pip安裝

pip install opencv-python 
pip install SimpleITK

以上這篇Python可視化mhd格式和raw格式的醫(yī)學(xué)圖像并保存的方法就是小編分享給大家的全部內(nèi)容了,希望能給大家一個(gè)參考,也希望大家多多支持億速云。

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